Instale o compiz-settings-manager via synaptic, depois de instalado altere os itens (não tenho certeza) prender janelas e fixar ou atrair ( eu disse que não lembro? ), mas é por aí.
alguns programas não se dão muito bem com o compiz e se comportam extranhamente, mas configurando direito dá para equilibrar entre efeitos visuais e comportamento de janelas.
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