1) E quais são as demais impressoras envolvidas?
marca e modelo, se possível; melhor ainda se tiver um link do fabricante
2) não entendi muito bem o contexto da frase: "migramos recentemente para o Ubuntu 16.04"
Isso quer dizer mais exatamente o quê?
migrou de uma versão anterior do Ubuntu? se sim, qual?
esse esquema das impressoras funcionava numa versão anterior do Ubuntu?
3) não está exatamente muito claro quanto a topologia (=layout físico) do que há aí.
3a) as duas impressoras com porta ethernet estão ligadas ao roteador?
3b) a impressora térmica Argox OS214-Plus PPLB está ligada numa porta usb de um computador, isto é, não está também ligada ao roteador?
3c) a topologia é algo assim?
roteador----| --------->printerA
|---------->printerB
|---------->computerX --------usb--------->printerArgox
|---------->outros computers
quando o tópico inicial diz: "As impressoras de duas bandejas possuem porta Ethernet e são ligadas aos computadores através de TCP/IP.", literalmente estão ligadas à computadores mesmo ou estão ligadas ao roteador, conforme o esquema acima?
Esclareça, por favor.
4) uma verificação desejável é ir testando uma a uma, apenas ela plugada, ou seja, despluga as três impressoras, depois pluga a printerA, testa mandando imprimir a partir de um computador específico da rede (sempre o mesmo) se funciona para a bandeja desejada; despluga printerA, pluga printerB, faz a mesma coisa; despluga printer A e B, pluga printerArgos, faz a mesma coisa. A ideia é analisar quebrando em partes analisáveis para ver se identifica alguma questão específica.
Se a impressora possui bandeja, possivelmente será possível comandar a impressão fazendo algo assim (supondo o CUPS instalado):
lp -o InputSlot=Tray2
teste também essa condição por linha de comando como indicado acima.
verifque as opções disponíveis fazendo:
lpoptions -l
(sinal de hífen mais letra ele no comando acima)
5) as impressoras estão trabalhando com IP fixo?
quando o tópico inicial diz: "Também ocorre de as etiquetas que deveriam sair na impressora térmica serem impressas na impressora de duas bandejas.", isso parece significar estar endereçando a impressão para a impressora errada e não apenas para a bandeja errada, o que pode significar alguma dificuldade com o IP atribuído a cada uma das impressoras.