Não é trocar a porta SATA, é trocar o cabo SATA!
Tem atualização de BIOS para esta placa mãe? É uma placa da MSI remarcada como sendo Positivo.
Edit:
BINGO!
Essa placa tem controladora RAID SCSI, controladora Marvel!
Então verifique as portas SATA nativas da Intel, use as portas nativas da Intel. Essa placa tem 6 portas SATA? 4 devem ser da Intel e 2 da Marvel.
Ainda sim, veja se é possível trocar o cabo SATA, mas tudo deve ficar melhor se usar as portas nativas da Intel.