Vencida a questão mais imediata e importante que é a recuperação dos arquivos pessoais, feito em seguida um imprescindível backup externo para não ter mais sustos como esse, seja por um disco externo, seja utilizando os serviços online (in cloud, nas nuvens) gratuitos existentes, tais como Drive do Google, OneDrive da Micrfosoft, Dropbox e outros tantos existentes, seja copiando para um dvdrom ou na pior das hipóteses para uma mídia não confiável como um pendrive, que ainda é melhor que nada, resta dar o passo seguinte que é perguntar:
Por qual razão o sistema operacional estava devolvendo a mensagem: "A estrutura necessita de limpeza"?
Alguma razão há de ter, já que em condições normais isso não é necessário.
Problemas no disco? Fez uma verificação de hardware?