Normal, ainda não vi uma instalação do Ubuntu que não seja a padrão que a atualização tenha corrido 100% bem. Conforme o LinuxDailyLog, o mais indicado é você primeiro desfazer TODAS as instalações/desinstalações que não sejam as padrões do Breezy. Por exemplo, se você removeu o Rhythmbox (que vem no Breezy) e instalou o Banshee (que não vem no Breezy), instale de volta o Rhythmbox e tire o Banshee. Mesmo assim, o sistema não fica dos melhores depois da atualização. Funciona e tal, mas fica mais lento do que uma instalação do zero.
Eu nunca recomendo atualizar o Ubuntu por qualquer método que seja, exceto o da formatação-instalação. Tem gente que reclama que até no Windows precisava formatar menos, mas no Windows tem opção de atualizar do XP pro Vista?