Olá
Entre em terminal e digite sudo dmesg
Será possível a você ver a listagem do que acontece na sua máquina, segundo a segundo.
À esquerda, observe os números que estão em segundos de tempo.
Vá analisando a lista é veja em qual momento o sistema para e espera algo ser feito continuando depois.
Exemplo:
03300 esperando elefantes
03500 elefantes completo em hci8
Ou seja, o imaginário processo elefantes demorou 2 segundos para ser processado.
Desta forma é possível se ir isolando alguns processos que possam "emperrar" a maquina.
Se quiser ver em modo gráfico, os logs do sistema também informam isto.