Olá andreceara,
Posso estar enganado, mas pelo que li, penso que este primeiro hd gerenciava os dois certo? E no meu infimo conhecimento tinha o Grub gravado na MBR e com a remoção do ubuntu não teria sido removido esse grub?
Posso estar errado novamente, mas seria um caso a pensar ter o Linux no primeiro HD deixando ele fazer as mudanças entre um e outro HD, como disse é mais uma forma de pensar junto pois não tenho como testar isso apesar de ter vários HDs disponiveis aqui o meu problema é não ter o windows.
T+
Vamos deixar mais claro: o primeiro hd é o HD de 500 e o segundo é o HD de 250.
Creto, não sei se existia esse gerenciamento como você fala. Para eu, os dois hd's eram independentes, sem o grub "mexendo" no hd de 250. Quando eu queria usar o HD de 250, eu ia no setor de boot e colocava ele como primeiro HD. Aí o Ubuntu entrava direto, sem aparecer nada de grub. Eu pensei que mexendo no HD de 500, apagando o ubuntu e recuperando o setor de boot do windows, eu não estaria mexendo em nada no HD de 250. Só que ao escolher o HD de 250 como padrão para iniciar a máquina apareceu a mensagem do tópico.