o problema é que com o Windows 7 a placa de vídeo roda numa temperatura bem menor [...]
Não é o problema, é a solução, pois esses computadores não foram projetados pensando no Linux e sim no 'Janelas", veja que na página de entrada da Asus para o notebook, no canto superior direito, consta a seguinte expressão: "ASUS recommends Windows". ! Alguma dúvida sobre isso?
Nos 15 minutos de pesquisa que fiz sobre esse notebook vi 99,9% de **
usuários de Windows reclamando** da alta temperatura, então, se o equipamento foi projetado para o 'Janelas' e ainda assim os usuários do sistema comercial esperneiam e reclamam da alta temperatura, imagine para o pobre do Linux que não possui nenhum, nenhum, nenhum, suporte e consideração do fabricante, que aliás está lá para ganhar dinheiro e não para qualquer outra coisa. Não adianta olhar o SO comercial e querer comparar com o Linux, são realidades diferentes de suporte à hardware, ainda mais quando se trata de equipamento tipicamente gammers.
Bem, vamos aos fatos, deveria estar sendo possível desativar a placa NVídia para o uso comum e operar apenas com o chipset da Intel, deveria ser possível fazer isso pelo Bumblebee.
Além disso, faça uma experiência com o Lubuntu, acho que compensa, de preferência usando apenas o driver nouveau, monte um live-pendrive e veja qual é o resultado, pois como o Lubuntu usa nada de recursos gráficos avançados, pode ser que o comportamento da GPU quanto a temperatura seja outro. No mínimo servirá para circunscrever a questão.
De toda forma, ainda que apenas de passagem e sem aprofundar o assunto, vi em algum lugar uma afirmação que esse sistema pode operar até 114 ºC sem problemas e que, inclusive, ele possui um sistema de proteção que faz o auto-desligamento no caso da temperatura exceda o limite, mas enfim, é algo a estudar melhor, como dito, vi isso apenas em vista rápida do assunto.