DESCONSIDEREM A MENSAGEM ACIMA!
O que faltou foram testes!
Com a ferramenta "Create a USB Startable Disk" do Ubuntu 8.10 É possível ter o boot em duas partições.
Fiz a primeira partição em FAT32 para ser reconhecida por qualquer computador como mídia de armazenamento de dados (pendrive propriamente dito).
Fiz a segunda partição em FAT32 (a ferramenta exige que seja FAT32 para que o Boot funcione) de 2,5GB para o sistema "portátil".
Está funcionando perfeitamente bem. Nos computadores com Linux, abrem-se as duas partições. Nos demais computadores, aparece apenas a primeira (a que preciso para ter acesso aos dados guardados).
Quando quero dar BOOT, o procedimento normal funciona tranquilamente.
Talvez tenha testado em uma placa que não reconheceu o boot pela segunda partição (sda2).
DICA: Criei ainda um link dentro de /home que "joga" a pasta "Meus Documentos" direto pro Pendrive, ficando meus arquivos pessoais dentro da partição DADOS e o restante do espaço no sistema para as instalações (BrOffice3.0 - K3B - etc).
Valew!