Ola o script eu nao testei no 12.10 mas nao sei se funciona, somente no 12.04, e funciona bem...ha muito tempo eu estava procurando uma forma de barrar o compiz nos games.
Para os emuladores nao tem necessidade como os emuladores de snes e mega....o que pega mesmo sao os games pesados, ai sim em placas de baixo rendimento vc nota bem a diferença de ter o compiz ativo durante o jogo ou nao.
Trocando em miudos, o undirect fulscreen do compiz so dunciona em tela cheia, se o game nao fica em tela cheia o compiz ainda permanece ativo.
No caso eu acho que da mais trabalho instalar o Wine somente para essa finalidade, vc precisaria rodar o script simples so uma vez, alterar o que pretende no caso o armazenamento ou algum configuração do flash e deixar o script de lado usando normalmente o navegador pois as configuraçoes estariam salvas para esse site.
http://www.youtube.com/watch?v=w-Ri-V8FEMkHa tbm a opção vc fazer um lançador em conjunto com o lançador do firefox na barra do Unity, tipo "firefox com compiz" e "firefox sem compiz" se quiser que tbm da certo