Experimente nas configurações do jogo mudar a resolução para a do seu monitor e a configuração de proporção de video também. Geralmente quando o jogo está numa configuração diferente da do sistema, quando você entra nele altera a do ambiente todo. É um bug clássico do ambiente gnome, que vez por outra ocorre (mesmo usando o Unity, o Cinnamon ou o Mate, pois eles são feitos a partir do gnome). Acontece com praticamente todos os jogos que usam renderização.