Li o artigo e um dos argumentos que eles tinham é caso o engenheiro responsável por administrar as ferramentas saia da empresa, como será possível verificar o que ele fez? Oras, se o código é aberto, qualquer um pode analisar. Acho que assim a empresa perde menos, pois com software fechado é impossivel ver suas configurações (a não ser por engenharia reversa, que é muito mais complicado).