Já faz um tempinho que não uso o LILO, mas basicamente após a instalação dele, o arquivo de configuração é criado em /etc/lilo.conf.
Diferentemente do Grub, a cada alteração na configuração, vc deve chamar lilo no console para regravar o LILO na MBR, com isso o Grub será substituído pelo LILO.
FaBMak