./ configure é para executar um script com o nome de "configure" que está dentro da pasta atual.
Normalmente os programas que você instala a partir do código fonte possuem um script como esse para poder fazer diversos testes e criar um arquivo de makefile adequado que você vai usar para compilar o programa (com o comando make).
Se vc diz que ./configure da um erro de permição negada então provavelmente ele apenas não está com a permissão de execução.
Digita
chmod +x configure
Isso vai dar permissão de execução para ele. Depois tenta o ./configure dinovo.