Dá para fazer no gimp.
Copie meu avatar, salve gomo gif e abra ele no gimp para ver como eu fiz.
O gimp não tem uma ferramenta para "automatizar" a confecçãqo de gif's animados como o animagif para Windows, mas dá para fazer "na unha" sem muitos transtornos.
Crie varias camadas e va travando e destravando por grupos ou individualmente para fazer a animação.
Voce pode tentar este =>
http://www.lcdf.org/gifsicle/ Tem no synaptic, eu nunca utilizei.
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