vc clica no botão no canto direito inferior 'Fechar', ou fecha tal janela pelo botão que tem um 'x'? se for pela segunda alternativa está aí o problema...
está usando uma versão diferente do firefox da que veio por padrão com o Ubuntu? (caso tenha instalado alguma versão diferente, qual foi o procedimento?)
Está disponível para você a opção de verifificar atualizações no menú 'Ajuda' (se não estiver disponível, pode ser que você não tenha as devidas permissões ao firefox)