Acesse como root
Quando você formata qualquer coisa em ext..., você precisa de permição para acessar esta pasta.
abra o terminal e digite
$
sudo nautilusColoque sua senha
Na janela que se abrir procure seu pen driver no lado esquerdo e click com o botão direto na pasta (ou em um lugar vaziu)
Mude as permições na aba permições, assim você terá acesso completo ao seu pen driver.
PS: Só para lembrar, qualquer dispositivo formatado em ext..., não será reconhecido no windows, ou seja, você não conseguirá acessar seus arquivos do pen driver no windows