Olá RonaldoRG, obrigado pela dica. O problema foi o seguinte: ao formatar eu não mexi na partição /home (o que não deve ser necessário), não sei porque mas ficou 2 partições extras (1 ntfs que guardo meus arquivos, e a outra era a antiga /home).
Solução: formatei novamente, dessa vez também formatei a /home (fiz um backup para a ntfs) e swap junto com a raíz, o mouse voltou a funcionar. Quanto ao compiz ainda não verifiquei, mas em breve avisarei.
Abraços