Olá rjbgbo,
Terei algum problema em configurar o GoogleDNS para o IPv6.
Você está afirmando ou perguntando?
Hoje quando estava instalando o Ubuntu 12.04, só fiz no IPv4, mas como ando lendo que tudo está migrando para o IPv6...
O IPv6 vem ativo por padrão no Ubuntu desde a versão 9, se não me engano. O problema é que, sem suporte do seu roteador ou do seu provedor, ele ao invés de ajudar atrapalha, tornando suas conexões mais lentas.
Pra utilizar realmente o IPv6, vc precisa que seu roteador seja ativado em IPv6, e precisa também que seu provedor esteja trabalhando em IPv6. E isso não vai acontecer tão cedo --- não espere isso em menos de 3 anos, aqui no Brasil.