Para colocar ícones na barra lateral do unity é simples:
primeira opção: Arraste para a barra o ícone do aplicativo
segunda opção: Abra o aplicativo e clique com direito no ícone que aparece na barra, peça para manter no lançador.
Para mudar a ordem que eles aparecem clique segure e arraste.
Conforme comentaram não dá para inserir nada na barra superior, isso tem sentido pois ela virou um menu.
Antes que você se sinta obrigado a usar unity, lembre-se que existe kubuntu, xubuntu, lubuntu, ubuntu educacional, ubuntu com gnome-shell, ubuntu mini e sei lá quantas mais.