O java disponível no repositório do ubuntu só abre o BB utilizando o navegador Firefox, pelo menos aqui comigo. Com o chrome/chromium tem que instalar o java da oracle.
Abs
Realmente, no Chrome o openjdk está com problemas mesmo, no Firefox chegou na tela de login do Banco do Brasil. Mas não acho q compensa instalar o java da oracle, pois pode resolver no momento, mas acaba ficando desatualizado com o tempo, cheio de brechas de seguranças que são resolvidos inclusive no openjdk 7 que vem no Ubuntu. Mais fácil usar o Firefox mesmo.