Ola
O shell do windows é diverso do shell do GNU/Linux
Um link (lnk) nada mais é que um atalho que utiliza comandos em shell para acessar o arquivo verdadeiro em outro local do disco no Windows.
Desta forma, jamais será possível abrir um arquivo link (lnk) do Windows em outro sistema operacional que seja.
Tenha acesso à maquina Windows, clique com o botão direito no arquivo .lnk e selecione => propriedades
Ali será possível acessar (ver) o real local do arquivo principal (ex.: c:/arquivos de programas/agenda/agenda.exe)
Com este endereço, é possível o acesso ao arquivo pelo linux utilizando o pacote samba
Importante notar que arquivos com extensão .exe compilados para o Windows não "rodam" ou seja, não funcionam em outro sistema operacional (Linux, Unix, Mac, etc.)
Existem pacotes como o Wine ou CrossOver por exemplo que "interpretam" arquivos .exe dentro do. GNU/Linux, mas nem sempre é garantido que funcione, exigindo conhecimentos avançados para tal.
Instale o Ubuntu num pendrive usando o programa Unetbootin (win, mac e linux) deixando uma parte do pendrive para modo de persistência
Inicie a maquina pelo pendrive e faça testes com o Ubuntu. Nada será alterado na maquina usando o Ubuntu pelo pendrive
Se desejar, contate o desenvolvedor da agenda que utiliza e pergunte se o programa é suportado no Linux (sou dentista, e 100% dos pacotes de agendamento de clinica não rodam no Linux nativamente) tive que fazer o meu próprio.
Qualquer outra duvida, fique à vontade para perguntar ao fórum
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