Tipo, para a sessão hoje quero usar o Unity. Para minha mãe eu quero que tenha a opção do KDE. Sei que se pode instalar os dois e ficam "misturados" isso eu não quero.
Como assim misturado? Quando você instala outro ambiente, é exatamente isso que acontece: aparece uma opção para escolher com qual ambiente vocẽ quer iniciar a sessão. Quando vocẽ loga o kde, não vem barra de unity, e vice versa.
É disso que você tá falando?
Ou você se refere aos programas, bibliotecas, etc?