Hum... Eu não tenho como fazer uma cópia de segurança agora, e esse processo é arriscado.
A questão na verdade é bastante simples de ser feita, pois se trata apenas de deletar poucos e determinados arquivos dentro da partição de boot, não há de fato um risco grande nisso, sobremais se seus arquivos pessoais estiverem em uma partição separada do sistema operacional Windows, ou seja, realmente isolados numa partição ntfs, entretanto, alterar partições e instalar sistema sem backup sempre pode acabar, em tese, num desastre quando não há backup, pois de repente, numa distração qualquer, se faz uma grande bobagem e lá se foram os arquivos pessoais sem backup.
Eventualmente, dependendo do volume dos seus arquivos pessoais, estude a possibilidade de fazer backup usando os serviços "in cloud", "nas nuvens", enfim, online, serviços esses gratuitos oferecidos por várias empresas, como o Drive do Google, o OneDrive da Microsoft e vários outros que similares que há por aí, enfim, eventualmente pode ser uma opção.