Não sei a resposta direta à questão e, pior, não tenho o wine instalado para testar [e sem nenhuma vontade de ter
], o que dificulta, pois se trata de uma ação composta, vez que o Microsoft Word é chamado de dentro do wine e não uma simples chamada comum de um programa, então, apenas como sugestão inicial a ser explorada.
De uma forma global creio que a questão pode estar vinculada ao arquivo:
/etc/gnome/defaults.list
Verifique nesse arquivo se há alguma linha relativa ao wine na qual se possa espelhar e tentar criar algo.
Quando se aplica o comando mimetype a um arquivo criado no word:
mimetype nome_do_arquivo_criado_no_word
resulta em (teste aí se é isso mesmo):
application/vnd.ms-word
Então possivelmente deveríamos ter algo assim naquele arquivo defaults.list, porém há o detalhe da chamada ser pelo wine.
Observo ainda que naquele arquivo já há uma linha dessa forma:
application/msword=libreoffice-writer.desktop
Pois bem, comece inutizando essa linha (acrescente um # no início dela) para vermos o que acontece.
Essa é apenas a primeira parte da questão, a próxima é definir um arquivo do tipo msword.desktop (ou algo parecido, porque tem antes o wine)
Esse arquivo msword.desktop criado com um conteúdo adequado deveria ser colocado em:
/usr/share/applications
Poderíamos tomar como base o "libreoffice-writer.desktop" já existente e adaptar para o msword.
O "pulo do gato", acho, estaria em adequar a linha:
Exec=libreoffice --writer %U
Suponho que aí deveria entrar a forma como o wine chama o msword.
Logo abaixo, em mimetype acrecenta o mimetype dos .doc como já mencionado e altera a linha Name e altera ainda StartupWMClass
Em linhas gerais talvez isso dê certo, mas como disse, é apenas um palpite, não tenho como testar isso pela falta do wine.