não sei se já serviria para você, mas tente isso:
1 - Alt + F2 para executar aplicação;
2 - Digite nautilus ssh://seulogin@servidorssh;
pronto, pelo menos a navegação em arquivos do servidor funciona em modo gráfico (nunca testei pra valer, prefiro linha de comando, então não tenho certeza de que para fazer alguma alteração tenha que se fazer uso de um gksudo)
Já li em algum lugar que dá para habilitar umservidor gráfico para ssh também, estou pesquisando, qualquer novidade eu posto aqui