O module-assistant é uma ferramente para a compilação de módulos para o Kernel Linux.
Numa explicação bem simples, os módulos funcionam como os drivers de hardware do Windows, ou seja, permitem ao Kernel Linux gerenciar determinado hardware.
Aqui um exemplo de uso do module-assistant para instalar o driver nVidia no Debian 5.0:
http://www.gdhpress.com.br/blog/mais-dicas-lenny/E para habilitar ou desabilitar os módulos (usa-se o termo "carregar"), o comando usado é o modprobe.