Oh, o que eu recomendaria era criar uma partição e configurar o ponto de montagem para /home quando instalasse seu Linux. Aí você depois pode formatar o sistema pela partição / e ter a /home intacta. Depois é só por na instalação que vai montar a outra partição em /home e que não é pra formatar. Com isso todas suas configurações serão mantidas, incluindo os e-mails.