Obrigado pela atenção, mas infelizmente ainda não resolvi o meu problema.
Já marquei a partição ntfs como boot, já mudei o root para (0,3) / (0,4) mas continua o mesmo. (0,4) Invalid Device Requested e (0,3) No Such Partition.
Quase como em tema de urgência coloquei o cd do Windows e fiz o FIXMBR, mas mesmo assim dá-me "Erro ao carregar o sistema operativo".
O que mais me intriga mais é que tudo isto estava bom até instalar ubuntu, foi ai que o Windows flipou. No sda5 visto do gparted, tenho uma marcação de um ponto de exclamação a dizer : "Impossível ler sistema de ficheiros!", mas pelo nautilus consigo explorar a partição e aceder aos ficheiros.
Não há mesmo nada que possa fazer, certo?
Cumps