o Mednafen também roda Master System, se não me falha a memória. e dentre todos os emuladores nativos de Master System que testei no Ubuntu, o do Mednafen foi o que me deu os melhores resultados e melhores gráficos.
o mesmo vale pra NES. dentre todos os emuladores nativos de NES que testei, o do Mednafen demonstrou ter o melhor desempenho e gráficos. mesmo eu usando OpenGL e ativando filtros HQ/Bilinear (ou equivalentes), a queda de desempenho na maioria dos emuladores era grande (e olha que minha placa de vídeo é uma Geforce 8500GT, com tudo instalado redondinho).
até mesmo o emulador de GBA incluso no Mednafen mostrou-se superior e mais estável que o Visualboy Advance que ele se baseou. no VBA, eu não podia definir tamanho de janela 3x e usar o filtro de imagem HQ que eu queria. ou um ou outro. aí eu usava 2x que funcionava, mas a tela ficava significativamente menor pro que eu precisava.
antigamente, quando eu usava mais o Windows, eu não botava tanta fé no Mednafen. já usava versões de emuladores de NES e Master System que me eram satisfatórias. mas desde que passei a usar o Ubuntu e procurava rodar emulação do jeito que rodava no windows, o Mednafen mostrou-se uma excelente alternativa. fica aí a dica.