Também tive esse problema, e só deu certo usando a sdl para o som como você mencionou.
Mas só precisa usar -ad sdl uma vez.
No entanto, o som não ficou muito bom.
Estou usando o snes9express agora. O som ficou bem melhor nele, mas não funciona o fullscreen. Então apenas aumento o tamanho da janela que para mim é suficiente.