O kernel PAE reconhece mais do que 4GiB pro sistema como um todo, mas continua com a limitação de 4GiB por processo.
Ou seja, vc pode ter centenas de processos pequenos, mas cada processo não pode crescer além dos 3,2GiB utilizáveis.
Pode ser que sirva, dependendo de como seja o modelo dos aplicativos dele. Ou pode ser que não...
... como o objetivo dele com esse servidor é primariamente ter uma plataforma pra rodar essa aplicação, e não como desktop, não deve ter os problemas mais comuns do sistema de 64 bits (drivers, codecs e plugin flash).
Acho que vale a tentativa.