Obrigado, esquici de citar esse detalhe. O Ubuntu sequer inicia se o HD maior estiver ligado, ele trava na barra de carregamento antes mesmo de a interface grafica iniciar....
Vou fazer os procedimentos e colacar os dados...
EDIT:
Deixei o hd do ubuntu e o maior ligados, travou no carregamento, apertei ctrl+alt+F1, continuou o carregamento.
No log do carregamento dava o seguinte problema: ata5 failed to set xfermode
Parece que o ubuntu teve q "ignorar" o hd maior para iniciar...
eric@eric-desktop:~$ sudo fdisk -l
Disco /dev/sda: 20.4 GB, 20490559488 bytes
255 heads, 63 sectors/track, 2491 cylinders
Units = cilindros of 16065 * 512 = 8225280 bytes
Disk identifier: 0xedaaedaa
Dispositivo Boot Início Fim Blocos Id Sistema
/dev/sda1 1 182 1461883+ 5 Estendida
/dev/sda2 * 183 668 3903795 83 Linux
/dev/sda3 669 2491 14643247+ 83 Linux
/dev/sda5 1 182 1461852 82 Linux swap / Solaris
# /etc/fstab: static file system information.
#
# -- This file has been automaticly generated by ntfs-config --
#
# <file system> <mount point> <type> <options> <dump> <pass>
proc /proc proc defaults 0 0
# Entry for /dev/sdb2 :
UUID=539415a3-5a47-4cc2-990f-cdbc44a5c3cf / ext3 defaults,errors=remount-ro 0 1
# Entry for /dev/sdb3 :
UUID=f4ad39b6-1bc4-451d-947f-6df61e5879a7 /home ext3 defaults 0 2
# Entry for /dev/sdb5 :
UUID=14d7b92f-2ddb-4217-818e-228d7e812d38 none swap sw 0 0
/dev/scd0 /media/cdrom0 udf,iso9660 user,noauto,exec 0 0
/dev/fd0 /media/floppy0 auto rw,user,noauto,exec 0 0
eric@eric-desktop:~$ blkid
/dev/sda3: UUID="f4ad39b6-1bc4-451d-947f-6df61e5879a7" SEC_TYPE="ext2" TYPE="ext3"
/dev/sda5: TYPE="swap" UUID="14d7b92f-2ddb-4217-818e-228d7e812d38"
/dev/sda2: UUID="539415a3-5a47-4cc2-990f-cdbc44a5c3cf" SEC_TYPE="ext2" TYPE="ext3"
Pelo que parece, ele "não achou" achou o hd... como disse acima, ele teve q ignorar...