Se o ícone do gdesklets aparece na tray (área de notificação), fica mais fácil, basta clicar com o botão direito do mouse nele e depois em
Configuration.
Agora, se por acaso você tinha configurado ele pra não aparecer na tray ou se por qualquer outro motivo o danado não está aparecendo, você terá que recorrer, adivinha, à linha de comando. Tanto faz se no terminal ou pelo Alt+F2, o que importa é executar:
gdesklets configure
Deve aparecer uma janela de configuração do gdesklets. Provavelmente a caixa
Translucency está marcada, apenas desmarque-a e reinicie o gdesklets. Ah, de novo: se o ícone do gdesklets não aparece na tray, você terá que fazê-lo pela linha de comando, na ordem:
gdesklets stop
gdesklets
Prontinho