amexudo,
pode abrir o explorador como root com o comando "sudo nautilus", mas aviso já que uma vez que você é iniciante corre um grande risco de fazer besteira.
O terminal é mais que suficiente para as tarefas que normalmente precisam root, os ficheiros que estão trancados são de sistema e não devem ser movidos.
Não existem arquivos escondidos que só o root consiga ver, arquivos escondidos em Linux são nomes começados com ., basta clickar CTRL-H no nautilus para ver eles.
