Para deixar a barra superior do gnome-shell no gnome 3 transparente.
Abra no seu editor de texto /usr/share/gnome-shell/theme/gnome-shell.css
encontre:
#panel {
background-color: black;
font-weight: bold;
height: 1.86em;
}
troque o "background-color: black;"
por
"background-color: rgba(0, 0, 0, 0.6);
Onde os três primeiros números são os parâmetros RGB (red, green e blue) e o último, é o quão transparente vc deseja.
valeu