Olá Maquiavelho,
Em primeiro lugar fico feliz por ter acompanhado o tópico e apenas com os caminhos indicados você conseguiu resolver o problema.
Como também disse anteriormente, sou bastante iniciante em muitos assuntos no GNU/Linux (senão em todos), por isso não posso te dar nenhuma certeza quanto ao seu questionamento:
(...)
Sabe me informar se a configuração que havia feito nesse arquivo é necessária para outros aplicativo entendam que estou usando um proxy?
(...)
Mas, como isso já devemos considerar um outro assunto, quem sabe formulando uma nova pergunta em um outro tópico e na sala especifica para tal pergunta, o fórum possa lhe auxiliar melhor!
Agradeço também por compartilhar da solução encontrada.
T+