Veja, /yashyn1987/,
Apenas mover arquivos de um diretório para outro não faz com que arquivos desapareçam, então ocorreu mais alguma coisa aí que não apenas movimentar os arquivos.
Se você explicar melhor o que realmente fez e como fez talvez seja possível melhor ajudar.
Quando se fala em perda de arquivos a primeira providência a ser tomada é não sobrescrever nada em cima do disco do qual se perdeu os arquivos.
Não grave nada por cima, não sobrescreva, essa é a primeira grande regra.
A pior coisa que se pode fazer é sobrescrever arquivos, pois aí elimina qualquer possibilidade de recuperação. Enquanto você não gravar nada em cima sempre há um chance de recuperar.
Suba o sistema por um live-iso (pendrive ou dvdrom) para ter acesso ao disco onde supostamente estão os arquivos perdidos.
Use o Testdisk para recuperar seus arquivos perdidos.
Esse tópico contém instruções bem detalhadas e pode te ajudar:
Arquivos, imagens, documentos excluídos acidentalmente.http://ubuntuforum-br.org/index.php/topic,117071.msg644760.html#msg644760