1) Defina melhor o que seja "parou de reconhecer".
Parou de reconhecer mais exatamente onde, no BIOS ou no S.O. ?
2) Por qual razão você crê que o fato de usar o formato H264 é pior?
Não é apenas mais um formato para compressão de vídeo como tantos outros e, por consequência, apenas um arquivo digital?
O ponto é: no que isso mais exatamente dificulta a suposta recuperação?
3) Mais exatamente onde esse Hd estava conectado?
Em que espécie de equipamento, com qual função?
4) Qual a marca e modelo do referido Hd DVR?
5) Você disse: "estava trabalhando em S.O. Linux dentro de um DVR".
Mais exatamente qual distribuição e versão de sistema operacional Linux?