Aparentemente resolvido. Segui as instruções do link que postei anteriormente, e com o seguindo comando removi o painel inferior:
$ sudo rm -r /usr/share/gnome-shell/extensions/window-list@gnome-shell-extensions.gcampax.github.com
Para voltar com ambos panéis, o seguindo comando deve resolver:
$ gsettings set org.gnome.gnome-panel.layout toplevel-id-list "['top-panel-0', 'bottom-panel-0']"
Desculpem pelo tópico e obrigado.