Só mais uma linha: antes de mais nada, após o boot do sistema ter completado, faça num terminal:
systemd-analyze
Veja se aparece algum mensagem quanto ao sistema ainda não estar carregado.
Se aparecer, então não adianta tentar fazer a atualização, precisa esperar processos se segundo plano terminarem.
Em algumas situações existem dificuldades quanto a isso, pois na verdade o sistema possui um mecanismo de atualização automática que é acionado toda vez que se inicia o sistema e a execução dessa verificação pode ser demorada, muitas vezes "trombando" com uma tentiva precipitada de fazer a atualização manual por linha de comando.
Mas se tudo estiver mesmo carregado e o boot realmente finalizado, então precisa destravar.