Se usar o codec
ALAC (Apple Lossless Codec de Áudio) não vai reduzir o tamanho, pois ele foi feito pela Apple exatamente para não perder qualidade, não vai fazer diferença se especificar bitrate.
Se a qualidade não for realmente importante então use o codec
AAC (Advanced Audio Coding), vai reduzir enormemente o tamanho e talvez também a qualidade.
Evidentemente é um pouco mais complexo que isso, mas aí precisa estudar mais a fundo os conceitos de cada uma dessas coisas e entender realmente o que significam.
Como não entendo nada disso e tenho ouvido musical de surdo, pra mim não faz diferença alguma, ainda mais se estiver ouvindo num computador e seu mirrado sistema de som, que não é exatamente um poderoso home theater de zilhões de watss RMS de potência, porém os especialistas e sobretudo aqueles dos quais se diz terem ouvido absoluto dizem que sim, que faz muita diferença.
Dê uma lida nesse link, onde há considerações interessantes sobre qualidade e ainda arquivos flac de exemplos que podem ser testados e comparados:
http://www.eclassical.com/pages/24-bit-faq.htmlJá que estamos num Linux, então usando o ffmpeg puro, como exemplo pode ser feito:
ffmpeg -i input.flac -acodec aac -b:a 128k -strict -2 output.m4a
Apenas para ilustrar, usando o arquivo de exemplo lá da página referência indicada, se obtém:
BIS1447-002-flac_24.flac.flac
originalmente ele tem:
tamanho: 106,2 MB (106.172.160 bytes)
taxa de amostra: 88200Hz
taxa de bits: 1622kbps
Se usar o codec alac:
tamanho: 111,2 MB (111.213.644 bytes)
taxa de amostra: 88200 Hz
taxa de bits: 2125 kbps
Se usar o codec aac com bitrate 256k:
tamanho: 13,8 MB (13.753.845 bytes)
taxa de amostra: 88200 Hz
taxa de bits: 259kbps
Se usar o codec aac com bitrate 128k:
tamanho: 6,9 MB (6.865.882 bytes)
taxa de amostra: 88200 Hz
taxa de bits: 128 kbps
Ou seja, vamos de 106,2MB para 6,9MB, o que é uma redução e tanto no tamanho, uma proporção cerca de 15 vezes menor.
Agora, para quem conhece realmente som, é uma questão de avaliar a qualidade.