Seu tema está modificado, não é o original. Talvez o erro seja no seu tema! Alguns temas são meio bugados e costumam estragar o sistema (interface). Já ocorreu comigo de um tema provocar erros na interface. Estou usando o Ubuntu 19.04, e nenhum deste erros ocorre comigo. Acho que o aplicativo da calculadora bem por padrão instalado via snap, e este costuma ter um problema de inconsistência com os temas.