Certo... me parece um pouco mais claro, só precisa confirmar com a equipe de TI e/ou segurança de sua empresa algumas coisas.
Quando você diz que a VPN é pra sua empresa, faz sentido pra mim que seja uma VPN split tunnel. Na VPN normal, sem ser split tunnel, todo o tráfego do usuário é direcionado pra VPN, e passa a ser responsabilidade do mantenedor da VPN fazer esse tráfego chegar na Internet. Normalmente vc faz isso quando quer que o seu tráfego fique associado com o mantenedor, e não com seu provedor de internet --- como quando você quer acessar conteúdo que não está liberado pro seu país, ou quando você está num Wi-Fi público desprotegido.
Já quando se tem VPN de empresa, normalmente vc usa o modo split tunnel, onde uma parte específica do tráfego é direcionado pra VPN, e outra parte ("o resto") continua saindo pela sua conexão normal.
E o que caracteriza a VPN split tunnel? Na VPN split tunnel, você não tem a rota default apontando para a VPN. Apenas a rede específica (normalmente a rede da empresa) é direcionada pra VPN.
Trazendo estas explicações pro seu caso, a gente vê na saída das rotas que você postou, que quando a VPN está conectada, você tem uma rota default principal (métrica 0) apontando para a VPN:
Tabela de Roteamento IP do Kernel
Destino Roteador MáscaraGen. Opções Métrica Ref Uso Iface
0.0.0.0 10.55.99.1 128.0.0.0 UG 0 0 0 tun0
Tem também uma rota default secundária (métrica 600) apontando pra sua conexão internet:
0.0.0.0 192.168.1.1 0.0.0.0 UG 600 0 0 wlp1s0
Justamente devido aos valores das métricas, a primeira rota vai ter preferência sobre a segunda. Eu acredito que a solução do problema passa por desativar essa primeira rota, se realmente for uma VPN split tunnel.
As demais rotas que você postou parecem ser as redes internas de sua empresa:
10.55.0.93 10.55.99.1 255.255.255.255 UGH 0 0 0 tun0
10.55.0.94 10.55.99.1 255.255.255.255 UGH 0 0 0 tun0
10.55.0.97 10.55.99.1 255.255.255.255 UGH 0 0 0 tun0
10.55.99.0 0.0.0.0 255.255.255.0 U 0 0 0 tun0
128.0.0.0 10.55.99.1 128.0.0.0 UG 0 0 0 tun0
Por fim, há a rota que garante que você continua conseguindo chegar no endereço do concentrador VPN da sua empresa pela sua internet normal:
187.72.54.26 192.168.1.1 255.255.255.255 UGH 0 0 0 wlp1s0
As duas rotas restantes são da sua conexão Wireless, e a rota link local.
169.254.0.0 0.0.0.0 255.255.0.0 U 1000 0 0 wlp1s0
(...)
192.168.1.0 0.0.0.0 255.255.255.0 U 600 0 0 wlp1s0