Acredito que sim Esfinge afinal eu apenas movi a pasta Mail de um para o outro e tudo já foi reconhecido automaticamente, inclusive os emails ainda não lidos.
Só não acho que será possível manter ligados ao mesmo tempo os dois programas, ai já deve até ser pedir demais, pois eles devem bloquear alguma coisa enquanto leem os arquivos, mas usar um, desligar e depois usar o outro não deve ser problema, até porque seria interessante manter os dois abertos simultaneamente?