Bom, para vc habilitar um repositório vc deve editar, como root é claro o arquivo /etc/apt/sources.list e acrescentar os repositórios, depois vc deve executar o comando apt-get update que atualizará sua base de dados. Feito isto vc pode instalar qualquer programa dos repositórios. Se vc não gostar da linha de comando vc pode usar o Synaptic que é um front-end para o APT. Muito intuitivo vc pode inclusive procurar programas pela descrição e palavras-chave. O Synaptic fica no menu System -> Administration ou Sistema -> Administração depende do sistema.
A grande sacada do APT é que já baixa o programa compilado e ser houver problemas de dependências, elas são resolvidas automaticamente através da baixa dos programas necessários. Nos programas gráficos, tipo o aMule é inclusive criado um link no menu do Gnome automaticamente!
FaBMak