-.-,
desculpe, mas pela pergunta parece que você não tem muita idéia de como um vírus, Trojan ou spyware age... nenhum deles, em qualquer sistema, vai ficar pedindo sua permissão para agir a cada vez, até que você perceba que aquilo é um vírus. Um malware, seja qual for, vai querer chamar o mínimo de atenção: dê permissão para que se instale e pronto; daí para a frente é com ele...
Embora o Linux seja um SO muito difícil de infectar ( nunca soube de um caso), vale lembrar que uma corrente é tão forte quanto o mais fraco de seus elos - no caso, o usuário. Em muitos anos de experiência, diria que 99% das infeçções que encontrei foram causadas diretamente pelos usuários, e estou falando de Windows, que é muito mais vulnerável. E foram causadas por downloads e cliques obviamente perigosos...
Se quer instalar coisas não confiáveis, depois não culpe o SO... no Ubuntu, você já conta com uma excelente firewall ( Iptables) instalada por default e configurável através do Firestarter; mas, novamente, sua segurança depende das permissões que concede através dela.
Repito, no Linux é baixa a chance de ser infectado, mas é o que você faz que define quão baixa ela seja... dê sempre preferência aos repositórios oficiais, e vá com cuidado com o resto!... Boa sorte!...
VB5