Skedar muito cuidado ao fazer esta operação. Dependendo de como estiver particionado seu HD a informação de UUID de alguma de suas partições (/home, swap, ou mesmo a raiz) podem mudar, causando problemas em montagem (/etc/fstab) ou mesmo no boot (/boot/grub/menu.lst).
Então faça como indicou o Arlei, mas ao final execute o comando:
$ blkid
E também:
$ sudo fdisk -l
E verifique os arquivos sitados. Caso tenha dúvidas com o UUID você pode retirar eles e trocar pelo arquivo em /dev (/dev/hda1, /dev/hdb3, /dev/sda1 e etc) referente à partição. O bom é que caso você tenta algum problema relativo a isto basta entrar com o LiveCD e recuperar muito facilmente, e em uma dúvida estamos sempre aqui para auxiliá-lo.
Uma última coisa, quando instalar o windows vai perder seu GRUB, então faça antes um disquete de boot para facilitar posteriormente a instalação do mesmo, ou leia como fazer para estar mais familiarizado. Existe um tópico excelente para isto, com muitas maneiras de recuperar o GRUB, eu faço diferente de como esta postado neste tópico mas ele ainda assim traz muitas (e fáceis/boas) formas de fazê-lo.