Gustavo,
Para o problema dos acentos em partições FAT32, a solução que encontrei foi essa:
Edite o /etc/fstab
Na linha referente a essa partição, acrescente:
iocharset=utf8
Fica mais ou menos assim:
/dev/hdb1 /media/dados vfat auto,user,iocharset=utf8,umask=000 0 2
Nas mensagens de boot, notei que o sistema dá um alerta sobre o uso da codificação utf8 em fat32, mas, acho que não é nada muito sério, hehe
Até