O Ruindows não grava como UTF-8, tem que montar como, se não me engano, ISO_8859_1
No fstab ou no momento da montagem você passa um parâmetro para isso, acho que é ns=iso?
Montando assim ele aparece direito, mas não me lembro como fica quando copia, só testando, pois em casa só tenho mesmo Linux e no trabalho eu monto mas nem me preocupei com isso...
Abraço...